区域与城市生态安全全国重点实验室以原“城市与区域生态国家重点实验室”为基础，整合中国科学院生态环境研究中心“土壤环境科学与技术实验室”以及中国科学院城市环境研究所“城市环境与健康院重点实验室”等相关力量组建而成。实验室依托中国科学院生态环境研究中心，与中国科学院城市环境研究所共建，针对我国生态系统质量低、功能弱和生态安全风险突出的问题，解析区域和城市生态系统演变规律、生态效应与驱动机制，突破基于大数据和人工智能的生态安全风险识别与预警技术，研发城市生态基础设施模拟优化和区域生态系统保护修复技术，为保障国家生态安全提供科技支撑。

实验室重点深化研究区域和城市生态系统演变规律与驱动机制，突破区域生态格局优化与生态保护修复关键技术，发展城市生态过程解析模拟技术与调控方法，阐明区域与城市的互馈机制及生态效应，支撑国家生态安全保障和可持续发展模式构建。