研究发现连续两年施肥处理后，施肥处理没有显著影响土壤细菌和真菌群落的alpha多样性，但显著降低了土壤原生生物群落的alpha多样性，且秋季原生生物群落alpha多样性高于夏季。在三种土壤类型下，施氮肥处理以及施氮肥和秸秆还田处理均显著改变了原生生物的群落结构组成，但对细菌和真菌群落组成的影响较少，表明土壤原生生物群落比细菌和真菌群落对施氮肥和季节变化响应更敏感。共现性网络分析结果表明，施氮肥处理显著降低了原生生物节点在微生物组互作网络关系中的节点比例，使得土壤微生物组互作网络关系更加紧密；施氮肥和秸秆配施的处理比单独施加氮肥的处理下土壤微生物组的互作网络关系变得更加紧密，对土壤理化性质和微生物组群落多样性影响更显著。